普查主要内容包括河湖基本情况、水利工程基本情况、经济社会用水情况、河湖开发治理情况、水土保持情况和水利行业能力建设情况。

　　普查第一次查清了流域面积在50平方公里以上河流的条数和长度，第一次查清了9000多万个小微型水电站、水闸、泵站等数量和分布情况，第一次查清了青海湖、西藏纳木错、新疆艾比湖等西部重要湖泊容积，填补了重大国情国力信息空白。

　　数据变化最大的是河流数量，公告显示，流域面积在100平方公里及以上的河流有22909条。而此前数据显示，这个量级的河流我国有5万多条。

　　水利部副部长矫勇表示，河流数据大幅减少，一方面确有一些河流因气候变化、社会经济发展等而萎缩消失，另一方面，此次普查利用了更精确先进的手段和技术，也是原因之一。中国水科院防洪减灾研究所学者陈晓陶也表示，差异巨大很可能因为这次统计更加精确，过去说的5万多条并不准确，是个大概数。但他同时认为，“中国河流数量大量减少是不争的事实。”